Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539935	2540136	202	47 [1]	[0] 49	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

TTGTTTGTAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTGCTGCTGTTGTTAAAGAT  >  minE/2539873‑2539946                                                              |             ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3588196/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1042395/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3116489/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3261321/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3305933/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3364335/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3432148/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3440470/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3447882/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3517922/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3522163/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:309524/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3625385/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:436723/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:473428/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:545201/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:597427/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:704960/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:711406/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:715322/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:751159/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:911828/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2283312/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1046501/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1063310/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1440045/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:171153/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1819064/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:1932666/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2045086/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2059438/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2076050/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2108038/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2186100/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:306608/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2466478/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2688040/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2691165/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:287365/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2933834/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2948711/62‑1 (MQ=255) ttgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGGTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3118032/62‑1 (MQ=255)  tgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:234710/61‑1 (MQ=255)  tgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:3136004/61‑1 (MQ=255)  tgtttgtAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:790774/61‑1 (MQ=255)             gCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTGCTGCTGTTGTTAAAGAt  >  1:2389336/1‑62 (MQ=255)                           cTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTgctgct              <  1:2965473/36‑1 (MQ=255)                                                              |             TTGTTTGTAAAGGCGATATTAGCCAACTATTACATCTGGGTTTAAATGGAGCGGTTGCTGCTGTTGTTAAAGAT  >  minE/2539873‑2539946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑