Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2541754	2541821	68	14 [0]	[0] 13	rfaZ	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

GATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGATTTT  >  minE/2541692‑2541753                                                              | gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:111858/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:1341058/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:2256614/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:2360460/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:25614/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:258610/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:3257700/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:3266063/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:3566620/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:380200/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:941608/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTATCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:3599322/62‑1 (MQ=255) gATTCACAAAGAACTGCTAATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:1205816/62‑1 (MQ=255)  aTTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGAtttt  <  1:3434707/61‑1 (MQ=255)                                                              | GATTCACAAAGAACTGCTGATCTCTGTACCGTTGTCTAAAAAAGGTCGTCTGGTTGGATTTT  >  minE/2541692‑2541753

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑