Missing coverage evidence...
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CAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCGG  >  minE/2547354‑2547415                                                              | cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3097295/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:995404/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:82699/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:781046/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:538538/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:511937/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:469685/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:410721/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3541186/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3338159/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3211968/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3192713/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3190735/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:1335977/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2994460/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2825943/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2776512/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:273494/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2730105/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2568257/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2440519/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2313760/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2300373/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2285432/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2029747/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:2026886/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:1604925/62‑1 (MQ=255) cAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:1445459/62‑1 (MQ=255)  aGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3402507/61‑1 (MQ=255)   gATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCgg  <  1:3143440/60‑1 (MQ=255)                                                              | CAGATCCACCAGGTTCACAAACTTGGTGCCGTCTTTCAGGTTGTCCACCACCAGAATATCGG  >  minE/2547354‑2547415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑