Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2554786	2554809	24	24 [0]	[0] 2	gpmI	phosphoglycero mutase III, cofactor‑independent

CATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACG  >  minE/2554725‑2554785                                                             | cATCAGCGACATCATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:678777/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2483581/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:855291/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:753073/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:637599/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:424977/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:404936/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:309095/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2603398/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2566992/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1306655/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2390753/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2170157/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2130205/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1883825/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:170138/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1664483/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1576607/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1548435/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1504063/61‑1 (MQ=255) cATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:1327328/61‑1 (MQ=255)            acaTGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:460667/50‑1 (MQ=255)            acaTGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACAGCTTTCACg  <  1:82107/50‑1 (MQ=255)               tGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACg  <  1:2268064/47‑1 (MQ=255)                                                             | CATCAGCGACAACATGGTCGGCGCGATGTCAGAAAGTTTGCCGCCTTCAACCGCTTTCACG  >  minE/2554725‑2554785

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑