Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2555321	2555365	45	41 [0]	[0] 57	gpmI	phosphoglycero mutase III, cofactor‑independent

TCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAGCGG  >  minE/2555260‑2555320                                                             | tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGGAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2932311/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3153747/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2454974/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2472726/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2511450/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2541981/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2698566/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2701562/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:284975/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2986587/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3137556/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:239171/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3164738/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3183850/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3206875/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3534007/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:3640792/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:511129/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:523025/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:690689/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:925249/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1728568/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1099084/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1223365/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1269897/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1454914/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1535691/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1567070/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1614437/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1653743/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1714041/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1021530/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1802806/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:1905257/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2036457/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2056639/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2060916/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2148462/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2149417/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:2301242/1‑61 (MQ=255) tCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAgcgg  >  1:237085/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCGCCGAAGGTGTTAACCAGGGAAGCGGGTGGGTAAGCAACCGCAGTTTTGATGTCAGCGG  >  minE/2555260‑2555320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑