Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	234254	234258	5	88 [0]	[0] 9	yaiI	conserved hypothetical protein

AGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGCC  >  minE/234192‑234253                                                              | aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGAGTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:338418/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3169461/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:367195/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3644028/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:36114/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:353464/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3534028/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3444294/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3365668/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3300049/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3257816/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:482472/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3126233/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3089902/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3058533/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3029273/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3021508/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3018853/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3015339/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2939589/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2907512/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1098100/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:688725/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:967738/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:918009/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:901119/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:843030/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:811992/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:786659/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:784051/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:759862/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:749937/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:738394/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:28949/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:624073/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:613170/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:612727/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:610684/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:606223/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:590524/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:580543/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:56074/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:533882/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1461283/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:224267/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2100163/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2098972/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2039541/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1752596/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1752450/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1700853/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1667420/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1590577/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1557431/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2252392/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:14606/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1458663/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1393672/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1357588/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1324964/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1315225/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1283456/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1275120/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1250228/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:1160837/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2460213/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2864289/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2765248/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2705248/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2672788/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2669104/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2607667/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2596343/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2508085/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2462044/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2880343/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2445688/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:241131/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2326966/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2317808/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2300944/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2300455/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2291328/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2276853/62‑1 (MQ=255) aGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGCATGcc  <  1:3509428/62‑1 (MQ=255)  gcgcGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2776423/61‑1 (MQ=255)          caATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:2241062/53‑1 (MQ=255)                        ccAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGcc  <  1:3102131/39‑1 (MQ=255)                                                              | AGCGCGACACAATAGAGGATTACCCAACAAAGGATGACTTTATGACAATTTGGGTGGATGCC  >  minE/234192‑234253

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑