Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2585228	2585234	7	77 [0]	[0] 7	mdtF	multidrug transporter, RpoS‑dependent

CGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTC  >  minE/2585182‑2585227                                              | cGTTTCGCGCCTTGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3192970/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGTTTACCGTTGTc  <  1:72794/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3023267/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3467791/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3455416/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:332970/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:329416/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3262304/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:325050/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3091112/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3081056/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:37337/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:300252/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2865255/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2859140/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2810676/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2677332/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2614395/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1084238/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:548137/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:971150/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:955615/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:903649/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:741701/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:673287/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:655529/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:575552/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:55060/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3592839/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:540886/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:448781/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:427590/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:426917/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:405608/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:400866/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:399185/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2577171/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1466929/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2495792/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1877137/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1870950/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1834282/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1821216/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1740110/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1638555/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1623325/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1596871/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1886612/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1437265/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1427187/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:136692/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1332574/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1261252/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1260064/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1238402/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1199694/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2206430/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:248617/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2447986/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2420021/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2363424/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:235876/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2308007/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2222451/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1910837/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2113650/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2106240/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2051123/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2039913/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2023666/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1951387/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1949985/46‑1 (MQ=255) cGTTTCGCGCCTGGGTTAGCTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2392241/46‑1 (MQ=255) cGTATCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:2732995/46‑1 (MQ=255)  gTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:1604299/45‑1 (MQ=255)  gTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:916220/45‑1 (MQ=255)  gTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTc  <  1:3442903/45‑1 (MQ=255)                                              | CGTTTCGCGCCTGGGTTAGTTTTTCGTGCCCCAGGTTACCGTTGTC  >  minE/2585182‑2585227

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑