Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2590210	2590323	114	44 [0]	[0] 3	hdeD	acid‑resistance membrane protein

GAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAG  >  minE/2590150‑2590209                                                            | gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCATCAGTGTGGAAACCAg  <  1:15915/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3395033/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2653472/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2731553/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2759626/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:280937/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2964278/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2968520/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2993440/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3054107/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3208407/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3342956/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2633826/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3468676/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3523275/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3552556/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3566678/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3579699/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:3625734/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:36357/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:367392/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:631060/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1940577/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1151244/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1171766/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1183572/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1290234/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1293506/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:136026/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1480342/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1604967/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1864901/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1049845/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1954670/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1967470/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:1986476/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2267841/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2389806/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:257985/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2584232/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2595838/60‑1 (MQ=255) gAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2615012/60‑1 (MQ=255)  aaGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:2332119/59‑1 (MQ=255)                        tAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAg  <  1:385321/37‑1 (MQ=255)                                                            | GAAGCTGAACAGGCTGGCGGCGCTAAATATCAGTTCAATTCCCACCAGTGTGGAAACCAG  >  minE/2590150‑2590209

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑