Missing coverage evidence...
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GTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGA  >  minE/2603541‑2603602                                                              | gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:3210724/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:100518/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2518180/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2587488/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2603320/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2781981/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2939126/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:3004689/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:3045670/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:242102/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:3463021/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:455567/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:486869/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:522001/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:651031/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:784848/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:814965/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:851816/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1739761/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1037299/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1063380/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1073644/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1084670/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1112397/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1221335/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1239833/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1341930/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1607563/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2408791/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1779409/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1846395/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:1950795/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2310715/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2332059/62‑1 (MQ=255) gTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2394878/62‑1 (MQ=255)  tCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2834786/61‑1 (MQ=255)  tCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGa  <  1:2602922/61‑1 (MQ=255)                                                              | GTCAGCCCTTGTGCATCCGCAAACCACATTCCCGCAGCTGCCGCCGTCAAAAAGCCCAGTGA  >  minE/2603541‑2603602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑