Missing coverage evidence...
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CAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCA  >  minE/2605005‑2605066                                                              | cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:354843/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2952068/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2960191/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3157845/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3306055/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:330968/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3322346/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3374914/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3412775/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:3424535/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2705441/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:421221/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:467293/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:499893/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:505942/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:510717/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:524166/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:633852/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:889141/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:954560/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1826947/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1098361/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1185138/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1247529/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1275147/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1439274/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1483534/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:149982/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1535743/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1537223/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:1071589/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:209599/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2115600/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2214636/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2356208/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2366451/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2412883/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2597692/1‑62 (MQ=255) cAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCa  >  1:2666894/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAGCGGAACAATCAGCATATCAACGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCA  >  minE/2605005‑2605066

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑