Missing coverage evidence...
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CGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCA  >  minE/240816‑240877                                                              | cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2945356/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:662473/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:432130/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:3609178/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:3405375/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:3240763/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:321900/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:3018963/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2991439/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:1060042/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2893869/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2636762/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2596680/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2406849/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:2045924/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:1940914/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:144044/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:1406810/62‑1 (MQ=255) cGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTACGTGAGCa  <  1:1560612/62‑1 (MQ=255)                ggcggcAGGAATCGAAATTCCTAGGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCa  <  1:3309575/47‑1 (MQ=255)                                                              | CGAGATCATATGCCCGGCGGCAGGAATCGAAATTCCTACGTTATGCGCCAGCTCCGTGAGCA  >  minE/240816‑240877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑