Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	246596	246627	32	23 [0]	[0] 8	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

GATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTAC  >  minE/246535‑246595                                                             | gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3011615/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:954660/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:910899/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:851235/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:624605/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:493540/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3789/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3500140/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3441311/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3295247/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3237485/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:3017983/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1072305/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:2689997/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:2388568/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:2201205/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1863379/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1669772/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1562969/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1525546/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1474538/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1374010/1‑61 (MQ=255) gATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTac  >  1:1227395/1‑61 (MQ=255)                                                             | GATCGCAGTATGACCCCGCCACCGGGGCGTGGTAGCTGGGAACCGCTACTATACGGCTTAC  >  minE/246535‑246595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑