Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	246815	246821	7	82 [0]	[0] 38	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

TGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTA  >  minE/246760‑246814                                                       | tGGCCGGTAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:459035/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGCACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3099684/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3428019/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3555003/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3403837/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3332613/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3306852/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3286741/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3281367/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3245803/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3240623/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3149794/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3084910/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3080889/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3052117/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2951215/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2903803/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2872/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2838839/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2812407/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1150534/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:797917/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:991391/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:95710/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:950052/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:928015/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:893144/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:881664/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:878649/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:867894/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:809925/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3547444/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:78563/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:735978/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:734632/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:462172/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:378582/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:371122/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:370765/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:3564030/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2801619/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1659386/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2789551/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1912525/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1896807/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1886886/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1852681/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1847613/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:183727/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1710466/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1709542/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1945063/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1653115/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1448677/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1369882/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1351336/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1321589/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1319917/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1268589/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:122245/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1164349/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2412210/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2697130/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2682099/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2669391/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2546944/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2536244/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2500068/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2486512/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2447509/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1960352/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2364625/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2321431/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2317404/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2285736/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2203926/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2133295/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:2103875/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1979950/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACATACTGCGTTAACCGGAGTTTa  >  1:1543714/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCATTAACCTACTGCGTTACCCGGAGATTa  >  1:3231189/1‑55 (MQ=255) tGGCCGGAAGATAACGGGCAGAAAATCCTTAAACTACTGCGTTACCCGGAGTTTa  >  1:1351790/1‑55 (MQ=255)                                                       | TGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTACCCGGAGTTTA  >  minE/246760‑246814

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑