Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2750915	2750924	10	74 [0]	[0] 56	rpsD	30S ribosomal subunit protein S4

ACCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGTT  >  minE/2750854‑2750914                                                             | aCCTGGGTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3442366/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2929186/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3419696/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3413588/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3193669/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3127306/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3067290/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3020397/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:298652/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2970426/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3438058/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2928314/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2886357/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:285729/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2818203/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2812650/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2666943/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2642276/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2598/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:762507/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:990073/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:988731/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:901876/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:866682/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:847821/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:847120/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:834997/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:806957/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3426349/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:680362/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:615337/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:598361/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:558258/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3631603/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3586753/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:3493216/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2581603/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1240753/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1596470/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1561391/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1539771/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1468012/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1465612/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1361880/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:130000/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:127957/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1651524/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1217206/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1154408/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1128138/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1085111/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1046682/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1041473/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1030615/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1016532/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2242057/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2539939/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2538523/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2486242/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2468189/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2452032/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2430892/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2353609/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2330567/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2282578/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1001173/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2225879/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2040490/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:2015538/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1951881/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1920307/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1714430/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1703891/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTATAAGCGTAAGCCGGAGCGtt  >  1:1488985/1‑61 (MQ=255)                                                             | ACCTGGCTGGAAGTTGATGCTGGCAAGATGGAAGGTACGTTTAAGCGTAAGCCGGAGCGTT  >  minE/2750854‑2750914

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑