Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2751826	2751868	43	39 [0]	[0] 10	rpoA	RNA polymerase, alpha subunit

GTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTA  >  minE/2751764‑2751825                                                              | gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:371631/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2672953/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2813499/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2834329/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2920850/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:3159875/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:3249505/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:349314/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:3526602/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:3606774/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2581606/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:377727/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:409387/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:410856/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:586215/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:651549/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:695566/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:781207/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:937921/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1644611/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1066736/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:116634/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1184491/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:121982/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1234814/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1238771/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1293272/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1485960/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1587317/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1055782/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1799893/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:1878416/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:200197/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2235579/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2318539/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2401172/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2454446/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:2487982/1‑62 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACCGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta  >  1:3557159/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTA  >  minE/2751764‑2751825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑