Missing coverage evidence...
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TCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAA  >  minE/2854437‑2854496                                                            | tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2914078/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:954581/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:867406/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:865394/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:539093/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:537694/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:395859/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:3625165/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:3530679/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:3390993/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:329183/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:3208728/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:3118336/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2988280/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:1160113/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2809519/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2713164/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2573873/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2491926/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2429850/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:2333470/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:226237/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:187177/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:1628099/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:1615089/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:1493349/1‑60 (MQ=255) tCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTaaaaa  >  1:1239659/1‑60 (MQ=255)                                                            | TCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAA  >  minE/2854437‑2854496

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑