Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2860515	2860556	42	10 [0]	[0] 40	mutL	methyl‑directed mismatch repair protein

CCAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTGCG  >  minE/2860454‑2860514                                                             | ccAGTGGCAGCACCTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:719303/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:1202767/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:1248141/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:1358010/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:1380638/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:2295695/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:3060152/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:432715/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:482159/1‑61 (MQ=255) ccAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTgcg  >  1:616278/1‑61 (MQ=255)                                                             | CCAGTGGCAGAACGTTGGCTGCGTCAGGCACAATTGACGCCGGGTGAAGCGCCCGTTTGCG  >  minE/2860454‑2860514

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑