Missing coverage evidence...
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GGTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGC  >  minE/2862472‑2862533                                                              | ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:347732/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2593133/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2743666/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1008737/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2861039/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:293317/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3114533/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3159365/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3443358/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3471539/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2776809/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3552610/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3577153/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:393661/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:510655/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:613036/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:627060/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:671664/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:808978/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:8546/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:25408/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1373863/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1434480/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1436630/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:172541/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1741340/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1774129/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1928768/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1946029/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1947920/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:1994746/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2114072/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2160984/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2197085/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2258176/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2393256/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2533467/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2546204/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTT‑AAATTGc  <  1:1091717/61‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGATGAAATTGc  <  1:489991/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGATAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:840414/62‑1 (MQ=255) ggTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTACTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:683133/62‑1 (MQ=255)            aGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:2833612/51‑1 (MQ=255)                     cccAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGc  <  1:3482732/42‑1 (MQ=255)                                                              | GGTAGCCGTAAAGCGCCGCACCCAAAGTATTTTGTAGGTGAAGGTAAAGCAGTTGAAATTGC  >  minE/2862472‑2862533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑