Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2883569	2883574	6	61 [0]	[0] 2	cpdB	2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase

CAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTGG  >  minE/2883507‑2883568                                                              | cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGTTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:553209/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3158665/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2221146/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2227571/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2235125/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2245620/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2299258/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2340029/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2586352/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2594154/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2626540/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2676565/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2743207/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2906667/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3086034/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3107463/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2217466/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3171051/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3204700/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3463616/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:346948/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3553791/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:3578175/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:362613/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:401642/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:423098/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:834290/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:908091/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:961470/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:986430/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1590104/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1045894/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1080641/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1124758/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1142589/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1143264/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1176011/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1239464/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1254172/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1255208/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1414183/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1415876/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1418956/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1470587/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1474789/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1561495/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1008735/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1650358/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1657423/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1679357/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1692555/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1803921/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1841534/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1855156/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1855983/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1860823/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:1941920/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2068776/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2142728/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTgg  >  1:2145894/1‑62 (MQ=255) cAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCATGTgg  >  1:3039191/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAGATAGCTATACATATTGTCGGCAGATTTACCGATTGGCTTGCTGACGAACTGGCGTGTGG  >  minE/2883507‑2883568

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑