Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2904838	2904895	58	52 [0]	[0] 6	treC	trehalose‑6‑P hydrolase

AGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTC  >  minE/2904787‑2904837                                                   | aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3614078/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3056199/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3172463/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3264904/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3269647/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3331754/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3337253/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3397003/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3423623/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3430016/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3485197/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3555847/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3577173/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3034327/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:3632446/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:366911/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:415320/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:503219/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:536701/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:551640/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:618484/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:644715/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:690288/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:734605/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:754764/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:797729/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2066579/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1225813/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1373076/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1387683/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1421415/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1452266/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1542939/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1639345/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:165210/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1677153/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2011806/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2048543/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2049833/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:1083729/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2131932/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2164904/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2362725/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:242513/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2435366/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2505949/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2530759/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2578589/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2588561/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2626746/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2655368/1‑51 (MQ=255) aGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTc  >  1:2972879/1‑51 (MQ=255)                                                   | AGGCCAATCCACGGTTCGCCAGCCGTAAACCCGGCATTATCGCCGTTGCTC  >  minE/2904787‑2904837

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑