Missing coverage evidence...
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CGGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCA  >  minE/2907614‑2907674                                                             | cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1231618/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1334930/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1736713/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1787596/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:2170204/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:2318460/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:2513193/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:2677140/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:3168829/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:382304/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:807402/61‑1 (MQ=255) cgGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGAGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1063057/61‑1 (MQ=255)       aaTTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1041182/55‑1 (MQ=255)       aaTTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCa  <  1:1516463/55‑1 (MQ=255)                                                             | CGGAAAAATTTAAAAACGGGAACGTTCCCGAAACGCAGCGAAGATCACAATTTATCGTTCA  >  minE/2907614‑2907674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑