Missing coverage evidence...
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CCATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTC  >  minE/2915434‑2915494                                                             | ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2322516/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:946359/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:3112086/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:3074591/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:3024219/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2934348/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2823756/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2507134/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2435363/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2419845/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2358133/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1083412/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2298290/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:2065303/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1824654/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1812046/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1660268/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1653009/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1187339/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1132202/1‑61 (MQ=255) ccATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTc  >  1:1109421/1‑61 (MQ=255)                                                             | CCATAAGGACTCCTTGATTTATTATGTAACATGCATTACAAAACTGTTTTAACTTTCTGTC  >  minE/2915434‑2915494

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑