Missing coverage evidence...
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GGTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCG  >  minE/2937713‑2937774                                                              | ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTGTAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1217763/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3183956/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2372452/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1028125/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2522929/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2634414/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2798489/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:30042/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3017656/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3095561/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2516180/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3229525/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3400459/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3566325/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:475922/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:517506/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:818947/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1362617/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1145968/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1243913/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1286142/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1294652/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:13199/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2325256/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1380498/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1412632/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1503165/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1631919/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1719867/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1745948/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2100946/62‑1 (MQ=255) ggTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:210366/62‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3021716/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3443430/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:3581168/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:36713/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:2375551/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:1161718/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:665544/61‑1 (MQ=255)  gTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCg  <  1:72219/61‑1 (MQ=255)                                                              | GGTGCGAGCAAGCTGGCGCTTGCATGGTGGCGTGCGACAGGTATAATCCACAACGTTTTCCG  >  minE/2937713‑2937774

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑