Missing coverage evidence...
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AGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCA  >  minE/2941149‑2941210                                                              | aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGTGTTGTGGGTCa  <  1:3155785/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1044478/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:886708/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:852388/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:759570/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:613312/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:52515/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:389292/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3614608/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3610550/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3510467/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3249120/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3207236/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3168425/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:3126865/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2882263/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1021841/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1076588/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2726754/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2713192/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:112549/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2178737/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2095275/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2842884/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1973339/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1834656/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1513448/62‑1 (MQ=255) aGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:1256804/62‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2001365/61‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:674143/61‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:581498/61‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:33536/61‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2758077/61‑1 (MQ=255)  gCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:2927108/61‑1 (MQ=255)                 cTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCa  <  1:26808/46‑1 (MQ=255)                                                              | AGCCAGCGCCGCGCCGCTGTTAATGCCGAGCAGTGAAGGAGAGGCCATTGGGTTGTGGGTCA  >  minE/2941149‑2941210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑