Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2962487	2962522	36	72 [0]	[0] 25	yjjI	conserved hypothetical protein

CAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATAG  >  minE/2962450‑2962486                                     | cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2741753/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:325832/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3155187/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3040328/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2929700/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:292766/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2838239/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2821667/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2783973/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3471927/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2740289/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:273090/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:267887/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2677005/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2664194/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2660965/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2597536/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2538259/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:533359/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:933986/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:917465/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:881297/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:847567/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:72739/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:626214/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:612472/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:573634/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1153336/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:444346/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:427527/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3644530/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3613525/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3599546/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:349498/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:3484289/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1547105/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2380184/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1764704/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1731241/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1722401/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1684715/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1589884/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1571448/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1559524/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1765990/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:147715/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1429908/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1396991/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1332758/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1331183/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1298465/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1233337/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1036284/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1905560/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2375999/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:235351/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2338647/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2330582/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2301416/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2298366/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2288165/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:226530/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2239895/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2222785/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2210473/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:217117/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:2068046/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1977289/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1901778/37‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGACag  <  1:2511231/37‑1 (MQ=255)  aGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:426776/36‑1 (MQ=255)  aGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATag  <  1:1293737/36‑1 (MQ=255)                                     | CAGGAAGCTATTCTCAAAGAAGTGTGATTGTTGATAG  >  minE/2962450‑2962486

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑