Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2969049	2969178	130	65 [0]	[0] 38	yjjJ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

CAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTG  >  minE/2968987‑2969048                                                              | cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCTCTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:142141/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2984928/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3510180/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3448278/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3444428/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3401542/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3301210/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3266936/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3057628/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:3012020/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:384517/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2980635/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2811828/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2783176/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2707882/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2658130/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:262200/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:371978/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2607810/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:447808/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:540472/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:556537/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:618545/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:62838/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:740513/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:744063/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:7805/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:791983/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:830923/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:838595/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:878541/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:997895/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:998488/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:197446/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1096248/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1113243/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1118565/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:119229/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1195190/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1376186/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1448927/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1450658/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1514699/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1521658/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1571519/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1616128/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1678370/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1878495/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1084640/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2052004/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2072898/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2134352/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2161460/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2237682/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2242291/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2379373/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2469674/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2483489/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2484049/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2499177/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2521064/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2568160/62‑1 (MQ=255) cAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2600913/62‑1 (MQ=255)  aaTGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:2906280/61‑1 (MQ=255)                        caacTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTg  <  1:1923707/39‑1 (MQ=255)                                                              | CAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCACCAGAGCGTGGCGCAAACAGAAGTG  >  minE/2968987‑2969048

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑