Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2979358	2979362	5	35 [0]	[0] 20	trpR	DNA‑binding transcriptional repressor, tryptophan‑binding

ACGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGT  >  minE/2979296‑2979357                                                              | aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGTGgt  >  1:3292902/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:36438/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2976362/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3067727/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3149721/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3263428/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3273821/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3336681/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:3520991/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2827708/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:364956/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:421265/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:574838/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:669464/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:722145/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:777099/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:836767/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:953880/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2207412/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:1318280/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:141959/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:1511651/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:1609935/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:1633351/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2102725/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2136160/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2194288/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:1293863/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2469163/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2595710/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2598803/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2687654/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2750622/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGgt  >  1:2809860/1‑62 (MQ=255) aCGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGACGAGCTGCGCCAGAGGCTGGAAGAGgt  >  1:2649621/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACGCGTGGATCTAACAGCCTGAAAGCCGCGCCCGTCGAGCTGCGCCAGTGGCTGGAAGAGGT  >  minE/2979296‑2979357

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑