Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	277320	277341	22	39 [0]	[0] 20	cyoB	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

AAGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAA  >  minE/277258‑277319                                                              | aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:40807/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3007468/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:319495/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3322871/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3440080/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3477712/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3561973/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3625111/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3637734/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:37339/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2987592/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:44625/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:475161/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:598360/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:824477/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:839725/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:858494/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:887097/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:957923/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2543511/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:1692519/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:1739481/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:1747877/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:1948595/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:20281/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2063851/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2111528/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2191368/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2248889/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:1540853/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2576366/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2710433/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:275297/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2760708/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:281442/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:284686/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2880964/62‑1 (MQ=255) aaGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:2937244/62‑1 (MQ=255)  aGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGaa  <  1:3548910/61‑1 (MQ=255)                                                              | AAGCCAACAATCGCCAGCCACCAGATATGCCAGATCATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAA  >  minE/277258‑277319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑