Missing coverage evidence...
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TGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAG  >  minE/287033‑287094                                                              | tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:1169095/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:1332630/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:1379143/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:1835175/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:2323388/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3128279/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3141403/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3398651/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3402862/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3468655/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3486650/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:3557353/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:358187/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:416113/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:568140/1‑62 (MQ=255) tGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAg  >  1:769369/1‑62 (MQ=255)                                                              | TGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAG  >  minE/287033‑287094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑