Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	305352	305353	2	90 [0]	[0] 15	ybaA	conserved hypothetical protein

CGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGA  >  minE/305303‑305351                                                 | cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3189142/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:548900/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:52118/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:481543/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:459317/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3590195/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3566260/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3542875/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3499996/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3445709/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3436224/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3411914/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:553899/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:315965/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:311646/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3103917/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:308953/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3055582/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3031039/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3015555/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:3000761/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:297739/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2911007/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:86447/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:999462/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:989147/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:952248/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:927537/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:902451/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:890953/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:885755/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:874268/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:871092/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:87029/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2850673/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:804533/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:788969/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:784133/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:739799/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:732575/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:694684/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:687561/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:681558/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:664485/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:612265/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1408626/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1967396/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1861920/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1721409/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:165086/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1649281/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1623142/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1618241/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:159401/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1447364/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1430794/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:197354/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1398733/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1330394/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:132899/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1251526/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1215821/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1186283/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1183299/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1167168/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1142141/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1128489/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2378620/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2837575/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2835136/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2711516/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2686584/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2683942/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:266477/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2556969/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2547902/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:253377/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2527293/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2474761/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:1056396/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2376086/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2372070/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2370049/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2368727/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2308454/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2141807/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:2124714/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:208929/1‑49 (MQ=255) cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:208272/1‑49 (MQ=255) cGTATCGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGa  >  1:154083/1‑49 (MQ=255)                                                 | CGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGA  >  minE/305303‑305351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑