Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	313329	313360	32	24 [0]	[0] 9	acrA	multidrug efflux system

GATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGA  >  minE/313267‑313328                                                              | gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACTGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:3473808/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:121135/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:367100/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:3165892/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:3014896/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:295697/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2840966/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2813441/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2544947/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2409255/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:229194/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2223591/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1694466/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1636146/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1568755/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1407716/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1385832/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1286765/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:12343/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1216251/62‑1 (MQ=255) gATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:1167141/62‑1 (MQ=255)  aTAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:2722316/61‑1 (MQ=255)   tAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:3620528/60‑1 (MQ=255)           gTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGa  <  1:637824/52‑1 (MQ=255)                                                              | GATAGACCCAGTGGTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGA  >  minE/313267‑313328

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑