Missing coverage evidence...
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GAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTCCC  >  minE/324533‑324594                                                              | gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:324086/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1032731/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2343325/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2624121/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2847673/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2898111/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:3066072/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:316686/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:3174580/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:3229000/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2182542/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:345532/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:35252/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:3537569/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:3607283/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:608789/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:683352/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:917761/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:961492/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1672065/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1086828/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1098694/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1099049/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1145175/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1220544/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1421369/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1482990/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1514130/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1595453/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2080048/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1673276/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:176434/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1782654/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1837999/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1891234/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:1953500/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2021542/1‑62 (MQ=255) gAACTATCTGCGCTTCGAGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTccc  >  1:2784373/1‑62 (MQ=255)                                                              | GAACTATCTGCGCTTCGTGCGTGGTCTGATTGACTCCAGCGATCTGCCGCTGAACGTTTCCC  >  minE/324533‑324594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑