Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	337336	337402	67	15 [0]	[0] 29	[copA]	[copA]

GCCGCATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCAA  >  minE/337275‑337335                                                             | gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:111594/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:1268623/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:1813185/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:1973191/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:2120940/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:2372975/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:2438764/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:2776662/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:3129624/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:314348/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:3268204/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:3430050/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:424912/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:805249/61‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCaa  <  1:9269/61‑1 (MQ=255)                                                             | GCCGCATCCGGCAGTCATGCGTCGATGCCAAATGCGCCACCCTAAAGCAGCGCATCCGCAA  >  minE/337275‑337335

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑