Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	361983	362069	87	23 [0]	[0] 72	sfmH	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CCGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTG  >  minE/361921‑361982                                                              | ccGTTGGTTACTCCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:3073830/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2841956/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:912675/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:763870/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:743395/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:401513/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:377280/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:35288/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:3200654/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:3089521/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2967423/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2924459/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2731799/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2640913/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:2175660/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1807574/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1792500/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1763333/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1591858/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:153004/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1504253/62‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:1209334/62‑1 (MQ=255)  cGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTg  <  1:110027/61‑1 (MQ=255)                                                              | CCGTTGGTTACACCTGTTTATACCATTAGTTTTGGTGGCCGGGTTGAAGTACCGCAAAACTG  >  minE/361921‑361982

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑