Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	363421	363428	8	24 [0]	[0] 21	fimZ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

GTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCG  >  minE/363359‑363420                                                              | gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTTAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3499270/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2924871/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:99789/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:712712/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:624674/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:43661/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3414425/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3244894/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3211746/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2646282/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2518336/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2377765/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2285308/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:2219409/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1850701/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1833567/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1818504/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1401164/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1367379/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1178829/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGATCg  <  1:3434422/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCGTCTGCTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3303152/62‑1 (MQ=255)        cGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTTAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:3495164/55‑1 (MQ=255)          tCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCg  <  1:1040172/53‑1 (MQ=255)                                                              | GTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAAATCAACAGGACGGGTTCG  >  minE/363359‑363420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑