Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	17936	17965	30	21 [0]	[1] 64	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

TTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGC  >  minE/17874‑17935                                                              | ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:108253/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:984571/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:955930/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:3617624/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:3294117/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:3289801/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:3270147/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:3239772/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:308500/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2879133/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2820830/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2486073/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2458803/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2416353/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:205094/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:1816567/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:1451670/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:1388771/62‑1 (MQ=255) ttGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:1169664/62‑1 (MQ=255) ctGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:1030118/61‑1 (MQ=255)  tGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGc  <  1:2668144/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGC  >  minE/17874‑17935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑