Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479945	479956	12	66 [0]	[0] 65	cydB	cytochrome d terminal oxidase, subunit II

CTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTG  >  minE/479890‑479944                                                       | cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2931339/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3371134/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3356141/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3260786/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:325385/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3221425/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3216006/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3189431/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3113970/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3382520/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2889156/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2841325/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2645768/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2606237/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2604405/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:257491/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1103970/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2559669/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:344820/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:3499698/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:675850/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:712400/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:714704/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:739050/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:756811/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:771231/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:779732/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:790505/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:790647/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:81789/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:877098/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:900597/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:936008/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1337405/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1817409/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1781938/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1750076/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1689178/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1673160/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1572534/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1560416/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1538630/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1848102/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1307332/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:118936/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1174257/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1154081/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:113907/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1128130/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1112699/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:250118/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1859700/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1897043/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:1933898/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2000798/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2064481/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2069397/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2121599/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2174778/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2178294/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2316281/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2404778/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2439328/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2462676/1‑55 (MQ=255) cTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2480663/1‑55 (MQ=255) atGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTtg  >  1:2775911/2‑55 (MQ=255)                                                       | CTGGTAATTGGTGTAGCGTTCGGTAACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTG  >  minE/479890‑479944

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑