Missing coverage evidence...
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TTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGT  >  minE/584943‑585003                                                             | ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2954614/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1023628/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:212055/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:246164/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2531517/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2535874/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2640786/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2761859/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2777398/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2778754/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2881792/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2098930/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:3162126/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:3484535/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:384624/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:506652/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:526332/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:572169/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:586129/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:781815/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:834922/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:90026/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1419800/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1067382/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1113187/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1132368/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1177662/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1222682/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1228771/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1231506/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1246502/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1306787/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:2065787/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1460036/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1484422/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1666882/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1709902/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1772531/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1776300/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1830231/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1868521/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1967160/61‑1 (MQ=255) ttAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:1972060/61‑1 (MQ=255)   aaGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGt  <  1:561814/59‑1 (MQ=255)                                                             | TTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGT  >  minE/584943‑585003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑