Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	612047	612047	1	21 [0]	[0] 46	ycaO	conserved hypothetical protein

CAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGT  >  minE/611985‑612046                                                              | cAACATCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:2325937/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGATGt  <  1:160262/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:2587623/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:834316/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:740289/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:666508/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:48716/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:4165/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:3400298/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:3350853/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:3267047/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:3181408/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:2509451/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:2287408/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:223834/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:2040151/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:1896196/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:1057484/62‑1 (MQ=255) cAACAGCTCACGCACACGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:1991881/62‑1 (MQ=255)  aaCAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:1008175/61‑1 (MQ=255)  aaCAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGt  <  1:3385815/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAACAGCTCACGCACGCGGGTAAAGTCATCAAAACCTTCTTCATCCAGTTGCTCGATGAGGT  >  minE/611985‑612046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑