Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	625108	625118	11	46 [0]	[0] 60	lpxK	lipid A 4'kinase

CAAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTGGCGGC  >  minE/625047‑625107                                                             | caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAATTCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3264019/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:448568/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1095848/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3044823/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3262974/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3383162/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3389197/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3537163/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:389119/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:441947/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:444017/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3038053/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:545410/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:561937/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:570670/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:663987/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:757927/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:778812/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:825927/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:96309/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:989821/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:198588/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1339269/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1344313/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1395350/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1419648/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1637984/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1672610/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:192007/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1924274/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1955606/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2809044/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:203625/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2165204/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:227543/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2385202/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2541498/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2545669/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2745795/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:2790557/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCCTTGTggcggc  <  1:823444/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGGCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:317909/61‑1 (MQ=255) caAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCT‑GTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:3036050/60‑1 (MQ=255)  aaaaTGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1882796/60‑1 (MQ=255)      tGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:437506/56‑1 (MQ=255)                    tGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTggcggc  <  1:1436471/42‑1 (MQ=255)                                                             | CAAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTGGCGGC  >  minE/625047‑625107

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑