Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	37513	37546	34	56 [0]	[0] 42	caiA	crotonobetaine reductase subunit II, FAD‑binding

CCGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATCAAC  >  minE/37463‑37512                                                  | ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2950590/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2302259/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2326242/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2428848/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2435509/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2494068/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2570803/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2612437/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2612955/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2682401/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2709229/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2861163/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2867718/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2898892/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2222063/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2994143/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3109598/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3325024/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:347769/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3529982/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3583023/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:358366/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3641194/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:3644931/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:645935/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:760302/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:983771/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1592843/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1007354/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:105279/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1054697/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1094271/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1115030/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1191013/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:124489/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1331708/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1349382/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1389518/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1395128/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:155522/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1561934/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:219174/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1603167/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1668537/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1757115/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1816619/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1843971/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1901970/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1968124/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:199990/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2057584/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2061119/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2185131/50‑1 (MQ=255) ccGAGCTTTACAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:2041631/50‑1 (MQ=255)  cGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:970270/49‑1 (MQ=255)       ttttCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATcaac  <  1:1002231/44‑1 (MQ=255)                                                  | CCGAGCTTTTCAAGTTTGGTCACTTTGATGCCCGGTTTGCTCATATCAAC  >  minE/37463‑37512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑