Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	658531	658543	13	98 [0]	[0] 35	ycbT	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAT  >  minE/658484‑658530                                               | cGATTACGCGAATGGATGCCATTTGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1532656/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2861510/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3330293/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:327171/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3241118/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3180351/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3124935/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:312278/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3097713/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:303742/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2988083/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2954206/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2863479/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3362403/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2773867/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:276389/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:276313/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2703353/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2617971/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2583391/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2569934/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2557478/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2506412/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2475155/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2416684/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:460976/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:892048/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:846496/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:816188/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:809273/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:78783/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:716493/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:629888/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:621548/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:576797/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:545460/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:536343/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1220776/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:44438/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:436033/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:435757/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:423410/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:393846/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:371353/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3611783/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3608855/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:35199/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3497026/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:149214/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1961317/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1118319/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1875769/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1790535/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1783518/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1758607/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1589157/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1573022/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1544178/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1523134/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:193562/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1468983/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1447841/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1395081/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1368231/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1363757/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1363129/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1325031/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1271334/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:126392/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2095224/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2354175/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2316726/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2315297/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2308/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:228656/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2251945/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2245512/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2227489/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2222666/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2183095/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2130154/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1967881/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2094267/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2093564/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2050481/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2043444/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2033500/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2006547/47‑1 (MQ=255) cGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1997877/47‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1516425/46‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:459396/46‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1710048/46‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1713137/46‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2023779/46‑1 (MQ=255)  gATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1958520/46‑1 (MQ=255)     tACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:2375504/43‑1 (MQ=255)         cgAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:1222632/39‑1 (MQ=255)           aaTGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAt  <  1:3341715/37‑1 (MQ=255)                                               | CGATTACGCGAATGGATGCCATATGCAGATAATCTTTGGAGAAAAAT  >  minE/658484‑658530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑