Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	669345	669350	6	16 [0]	[0] 33	pqiA	paraquat‑inducible membrane protein A

GGTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACG  >  minE/669283‑669344                                                              | ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:1739338/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:2105306/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:2143414/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:2254778/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:2442586/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:2995421/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:53715/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:690324/62‑1 (MQ=255) ggTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:788354/62‑1 (MQ=255)                        aTGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  <  1:1112501/39‑1 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:2544745/1‑36 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:3103906/1‑36 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:328119/1‑36 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:3583070/1‑36 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:3614586/1‑36 (MQ=255)                           ccAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACg  >  1:847422/1‑36 (MQ=255)                                                              | GGTTATGGGACGACATCGCCCCGATGCCAGAACTGCGCCAGCCGCTAAAACCAGGCGTCACG  >  minE/669283‑669344

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑