Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	692514	692570	57	40 [0]	[0] 16	hyaD	protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins

AGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTG  >  minE/692452‑692513                                                              | aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACTCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3595993/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3606738/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1038955/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3129540/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:314946/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3313690/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:342388/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:343017/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3491030/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3511566/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3066304/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3638306/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:40177/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:506392/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:555038/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:719273/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:780805/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:876790/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:883886/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:216348/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1433342/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1631810/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1857260/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1935460/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2113684/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2126171/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3040917/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:220630/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2397472/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2474968/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2621352/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2670053/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2977883/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2990110/62‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGCTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:3472302/62‑1 (MQ=255)  gTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1830845/61‑1 (MQ=255)           aGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1877090/52‑1 (MQ=255)               ttCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:2490939/48‑1 (MQ=255)                 cATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:1669246/46‑1 (MQ=255)                   tGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACctgctg  <  1:855041/44‑1 (MQ=255)                                                              | AGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTG  >  minE/692452‑692513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑