Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	696214	696355	142	39 [0]	[0] 3	appB	cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

TTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCC  >  minE/696152‑696213                                                              | ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCATGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGCGCATTATTTgcc  <  1:3078255/62‑1 (MQ=38) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3515989/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2457460/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1262464/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2833766/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:285039/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2905241/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3146191/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3223986/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2714613/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3519514/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3606486/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:557986/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:695844/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:695863/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:762724/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:969146/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2221751/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1325311/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1658260/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1658358/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1670221/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1858190/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1945488/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1975162/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2029381/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2031322/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2103091/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2191740/62‑1 (MQ=255) ttGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGGCTGGTTGATCCTCGCTGGGGGGGCATTATTTgcc  <  1:435639/62‑1 (MQ=39)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2012823/61‑1 (MQ=255)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:299131/61‑1 (MQ=255)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1862941/61‑1 (MQ=255)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:682679/61‑1 (MQ=255)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1663390/61‑1 (MQ=255)  tGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:2294464/61‑1 (MQ=255)     tGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3059591/58‑1 (MQ=255)      gCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:3546858/57‑1 (MQ=255)                         aGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc  <  1:1731309/38‑1 (MQ=255)                                                              | TTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCC  >  minE/696152‑696213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑