Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 696460 696536 77 102 [0] [0] 21 appB cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

Only 100 of 102 total aligned reads displayed.

CGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTG  >  minE/696423‑696459
                                    |
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCGCACCGCAATTACGCGTg  >  1:3345872/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3191191/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3609877/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3603276/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3567673/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3566812/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3564297/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3470050/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3448064/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3327018/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3275973/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3203099/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3196193/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3627211/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3163242/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3141788/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3091150/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3025464/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3001194/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2956246/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2950131/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:29053/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2897475/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2881969/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:287782/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:666755/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:927483/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:895347/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:894974/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:894019/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:872787/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:853510/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:849538/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:795498/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:745020/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:736612/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:709464/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:680287/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2871242/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:663188/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:63711/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:617995/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:573236/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:516285/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:514907/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:466470/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:463871/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:460984/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:44589/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:3641579/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1469573/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2058377/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2052696/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1961019/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1946469/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1922804/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1905068/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1794362/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1722498/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1679564/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1668937/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1572651/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1472246/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2148522/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1450394/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1441028/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1356448/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1329241/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1319621/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1314593/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1211289/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1193677/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:113179/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:110547/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1093982/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2403607/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2838769/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2802647/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2774482/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2699898/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2675856/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2535854/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2530141/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2503894/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2482588/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2453893/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2452973/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2431753/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:1089028/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2378207/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2363249/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2356712/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2356019/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2312197/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2309784/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2301527/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2295466/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2209400/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2182799/1‑37 (MQ=255)
cGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTg  >  1:2159058/1‑37 (MQ=255)
                                    |
CGGCGTGCCGTTTGCCTTCACACCGCAATTACGCGTG  >  minE/696423‑696459

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑