Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	791386	791428	43	81 [0]	[1] 71	dadX	alanine racemase 2, PLP‑binding

GCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCAC  >  minE/791326‑791385                                                            | gCTGGAAGGATTTTTCCATGTTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:796031/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCTGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2049730/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGTAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2604499/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGTCCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2302833/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3253384/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3535675/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3524033/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3512973/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3471856/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3418600/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3405176/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3287669/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3599423/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3217755/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3214965/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:309777/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3066624/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3047984/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3001024/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2951850/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2931379/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2875414/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:670059/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:995100/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:90578/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:898567/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:870844/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:868567/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:839617/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:7992/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:798703/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:745459/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3543443/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:612396/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:553639/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:53245/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:445468/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:42305/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:385601/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:374154/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:3633269/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2864331/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1557970/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:187908/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1878181/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1873245/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1842003/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1833219/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1720132/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1629474/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1584317/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2072197/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1439516/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1290061/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1284135/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1174438/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1154164/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1144912/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1067997/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1009011/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2627670/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1000927/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:284426/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2794288/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:277212/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2702334/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2670299/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2668103/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2646738/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2637254/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2094406/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2546943/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2511893/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2314767/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2228173/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2197474/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:2136731/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGAACCGCCTGaccac  <  1:2580109/60‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGAACCGCCTGaccac  <  1:2874184/60‑1 (MQ=255)  cTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:880444/59‑1 (MQ=255)        tgATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGaccac  <  1:1795568/52‑1 (MQ=255)                                                            | GCTGGAAGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCAC  >  minE/791326‑791385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑