Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 792590 792678 89 55 [1] [0] 3 cvrA predicted cation/proton antiporter

GCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCTTCAACAC  >  minE/792528‑792596
                                                             |       
gctaTAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:3004770/59‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:407127/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2761536/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:278494/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2791540/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2804539/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2810606/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2833473/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2944554/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:3080718/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:31598/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:3198630/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:3255605/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:3529779/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2752056/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:416165/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:677689/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:686311/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:741075/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:77595/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:835859/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:917475/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:943384/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:957456/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:95826/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:960001/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:985259/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1967664/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1147699/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1220696/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1254434/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1294214/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1318420/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1345650/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1467657/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1572103/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1667396/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:166775/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1738258/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1848770/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1944332/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:1064816/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2035474/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2113682/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2145542/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2164269/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2231167/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:246124/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2487501/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:257168/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2613690/62‑1 (MQ=255)
gCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2739482/62‑1 (MQ=255)
               ttAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCTTCAacac  >  1:2127572/1‑54 (MQ=255)
                      tAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:247514/40‑1 (MQ=255)
                          aTTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCt         <  1:2899764/36‑1 (MQ=255)
                                                             |       
GCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAATCTTCAACAC  >  minE/792528‑792596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: