Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	54941	55008	68	76 [0]	[0] 31	imp/djlA	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity/DnaJ‑like protein, membrane anchored

CTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAT  >  minE/54879‑54940                                                              | ctttCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3568455/4‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2930766/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3156594/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3149982/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3123359/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3116931/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:309527/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3080647/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3033697/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:29940/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2950501/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3196607/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2897453/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2883076/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:286978/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2827296/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2814093/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2813944/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2809784/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2709288/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3538427/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:96943/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:96678/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:638917/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:62101/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:546832/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:452152/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:438414/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3555986/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2690599/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3532033/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3461320/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3443950/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3361884/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3339971/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3325689/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:3255383/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:322001/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1263430/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1582785/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1572705/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1564007/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1525042/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1467146/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1439077/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1375624/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1353137/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1333318/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1653705/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:122282/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1221004/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1203334/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1192734/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1188404/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1186678/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1124330/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1111623/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:208716/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2687262/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2686481/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2625112/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2607547/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2397694/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2368629/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:229570/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2246980/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2183673/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1037185/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:2081640/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1997296/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:190696/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1885468/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1834446/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1831876/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1810639/1‑62 (MQ=255) cTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAt  >  1:1737159/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAAT  >  minE/54879‑54940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑