Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 824655 824761 107 38 [0] [0] 4 chaC regulatory protein for cation transport

CTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGACC  >  minE/824593‑824654
                                                             |
cTGGTGTCATCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2972127/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:52777/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1053035/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2791472/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2825065/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:3076940/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:3113498/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:3164363/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:3358883/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:481210/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2785389/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:583534/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:678757/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:684400/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:687792/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:694351/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:853776/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:966738/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:967617/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1752219/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1122866/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1138962/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:11488/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1163091/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1322269/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1381097/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1628901/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1712844/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2716020/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1981645/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:1987774/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2183910/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2370912/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2446480/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2500259/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2653990/62‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCAGCCTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:649598/62‑1 (MQ=255)
 tGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGAcc  <  1:2293350/61‑1 (MQ=255)
                                                             |
CTGGTGTCAGCTTGATCTTGATGATGGACGCACAGTAAACGCCATTGTGTTTATTATGGACC  >  minE/824593‑824654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: